Črevný mikrobióm je spoločenstvo mikroorganizmov, ktoré žijú v našom tráviacom trakte, najmä v hrubom čreve. Patria sem predovšetkým baktérie, ale aj ďalšie mikroorganizmy.

Tieto mikroorganizmy nie sú iba pasívnymi obyvateľmi čreva. Pomáhajú spracovávať časti potravy, ktoré sami nedokážeme úplne stráviť, najmä niektoré druhy vlákniny. Pri tom vytvárajú rôzne látky, napríklad mastné kyseliny s krátkym reťazcom, ktoré ovplyvňujú prostredie v čreve, črevnú bariéru, imunitný systém aj metabolizmus.

Preto je mikrobióm dôležitý nielen pre trávenie. To, čo sa v čreve deje, môže ovplyvňovať aj procesy mimo samotného čreva.

Neexistuje však jeden „dokonalý mikrobióm“, ktorý by mal vyzerať rovnako u každého človeka. Zloženie mikrobiómu sa medzi ľuďmi prirodzene líši a samotný počet alebo pestrosť baktérií ešte automaticky nehovorí, či je črevo zdravé.

Dôležité je preto pozerať sa aj na to, ako črevo reálne funguje – či je trávenie pravidelné, či sa neobjavujú výrazné bolesti, nadúvanie, hnačky alebo zápcha a či črevné ťažkosti nezasahujú do bežného života.

O mikrobióm sa staráme najmä tým, aké prostredie mu dlhodobo vytvárame – stravou, dostatkom vhodnej vlákniny, fermentovanými potravinami, pohybom, spánkom a rozumným používaním antibiotík.